MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bdellovibrio bacteriovorus HD100

Total Repeats: 4880

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005363	A	6	6	1481	1486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005363	T	6	6	1531	1536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005363	CTA	5	15	1581	1595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_005363	TA	5	10	1602	1611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005363	ATA	2	6	1619	1624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005363	ATG	2	6	3907	3912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005363	T	6	6	6387	6392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005363	AAG	2	6	11332	11337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005363	T	6	6	11385	11390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005363	TGA	2	6	11400	11405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005363	GTG	2	6	12341	12346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005363	TGA	2	6	13995	14000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005363	ATT	2	6	15396	15401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005363	GGCTTA	2	12	15407	15418	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_005363	AGA	2	6	17306	17311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005363	AGTAA	2	10	21692	21701	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005363	AC	3	6	21723	21728	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_005363	ACA	2	6	22415	22420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_005363	T	6	6	25165	25170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005363	A	6	6	25297	25302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005363	CAT	2	6	25333	25338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_005363	GTCT	2	8	25341	25348	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_005363	GA	3	6	25353	25358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005363	AAAAGC	2	12	27564	27575	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_005363	T	6	6	27595	27600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005363	CA	3	6	29308	29313	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_005363	ATT	2	6	31195	31200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005363	CTTTT	2	10	31234	31243	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_005363	T	6	6	31256	31261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005363	T	6	6	32272	32277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005363	GAC	2	6	32541	32546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_005363	CGTG	2	8	35025	35032	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_005363	GTG	3	9	35030	35038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005363	AAGG	2	8	36088	36095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005363	CTG	2	6	36115	36120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_005363	T	6	6	36134	36139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005363	CAC	2	6	38551	38556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_005363	AGG	2	6	38597	38602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005363	TTC	2	6	44355	44360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_005363	CAATTG	2	12	47735	47746	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_005363	CTT	2	6	47814	47819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_005363	AAG	2	6	49281	49286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005363	ATGG	2	8	49342	49349	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005363	CGAA	2	8	49562	49569	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_005363	T	6	6	49629	49634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005363	TCT	2	6	52649	52654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_005363	T	7	7	52662	52668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005363	TAA	2	6	57296	57301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005363	A	6	6	58724	58729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005363	TTTTTG	2	12	58755	58766	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005363	TTAC	2	8	59184	59191	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_005363	ACTT	2	8	59253	59260	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_005363	TCT	2	6	59340	59345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_005363	GCC	2	6	59393	59398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_005363	GGC	2	6	59424	59429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_005363	TA	4	8	59484	59491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005363	T	6	6	59498	59503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005363	T	7	7	61334	61340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005363	TCC	2	6	61810	61815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_005363	G	6	6	61925	61930	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005363	AT	3	6	61979	61984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005363	TG	3	6	62000	62005	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005363	TCG	2	6	62009	62014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_005363	A	7	7	62041	62047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005363	ATT	2	6	62117	62122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005363	GGA	2	6	62402	62407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005363	ATG	2	6	62482	62487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005363	T	6	6	65763	65768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005363	CAAC	2	8	66615	66622	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_005363	AAAG	2	8	66632	66639	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005363	A	6	6	67650	67655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005363	AGG	2	6	67670	67675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005363	A	7	7	67699	67705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005363	GGAA	2	8	71320	71327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005363	GCA	2	6	72988	72993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_005363	GGC	2	6	72997	73002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_005363	TGC	2	6	73010	73015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_005363	AAC	2	6	73024	73029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_005363	TTC	2	6	73166	73171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_005363	A	6	6	73175	73180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005363	AAT	2	6	73194	73199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005363	CTGG	2	8	78815	78822	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_005363	TCA	2	6	78873	78878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_005363	TCG	2	6	80475	80480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_005363	AGT	2	6	83722	83727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005363	GGT	2	6	85288	85293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005363	AGT	2	6	85314	85319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005363	AAAT	2	8	85372	85379	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005363	TGAAGG	2	12	85912	85923	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005363	GAGG	2	8	85993	86000	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005363	CACC	2	8	86064	86071	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
92	NC_005363	CGGT	2	8	86078	86085	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_005363	TCTA	2	8	86194	86201	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_005363	T	7	7	86296	86302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005363	AAT	2	6	86308	86313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005363	GC	3	6	86343	86348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_005363	CGT	2	6	86369	86374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_005363	T	6	6	86636	86641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005363	GAC	2	6	86763	86768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_005363	AGG	2	6	86816	86821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005363	TAGC	2	8	88088	88095	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_005363	ATT	2	6	88584	88589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005363	ACA	2	6	88598	88603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_005363	GCC	2	6	88604	88609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_005363	CCT	2	6	88701	88706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_005363	T	7	7	88761	88767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005363	GC	3	6	90675	90680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_005363	TTCA	2	8	90689	90696	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_005363	ACT	2	6	92804	92809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_005363	CTGCC	2	10	94454	94463	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
111	NC_005363	A	6	6	95715	95720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005363	CCCTT	2	10	96390	96399	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
113	NC_005363	A	6	6	96403	96408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005363	G	7	7	96430	96436	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005363	ATTCA	2	10	96461	96470	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_005363	TCG	2	6	96521	96526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_005363	TGT	2	6	96596	96601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005363	TTC	2	6	96676	96681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_005363	T	6	6	96694	96699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005363	AC	3	6	96703	96708	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_005363	CAT	2	6	96716	96721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_005363	T	6	6	96761	96766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005363	AAAG	2	8	96804	96811	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005363	AGG	2	6	102007	102012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_005363	TC	3	6	105657	105662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_005363	TCC	2	6	106351	106356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_005363	AAC	2	6	106415	106420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_005363	TCC	2	6	108314	108319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_005363	TTC	2	6	108327	108332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_005363	GGT	2	6	108398	108403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005363	TA	3	6	108413	108418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_005363	CT	3	6	108481	108486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_005363	TG	3	6	108547	108552	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_005363	TCG	2	6	108563	108568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_005363	CGT	3	9	108573	108581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_005363	ACG	2	6	108588	108593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_005363	GAG	2	6	111479	111484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005363	A	6	6	111504	111509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_005363	ACC	2	6	120584	120589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_005363	GGT	2	6	120689	120694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_005363	AT	3	6	120723	120728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_005363	GTTTT	2	10	121838	121847	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_005363	AG	3	6	121849	121854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_005363	TCGC	2	8	128243	128250	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_005363	GTT	2	6	131904	131909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_005363	A	6	6	136761	136766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_005363	ACT	2	6	140974	140979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_005363	ATT	2	6	141013	141018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_005363	A	7	7	141051	141057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_005363	TTTA	2	8	144011	144018	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_005363	GAAA	2	8	152971	152978	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_005363	A	6	6	152981	152986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_005363	TTTA	2	8	154207	154214	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_005363	A	6	6	154256	154261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_005363	TGA	2	6	154263	154268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_005363	ATT	2	6	154573	154578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_005363	TCA	2	6	154608	154613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_005363	CAT	2	6	155308	155313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_005363	CTT	2	6	155383	155388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_005363	A	6	6	159321	159326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_005363	CT	4	8	160080	160087	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
162	NC_005363	T	6	6	160104	160109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_005363	TA	3	6	160183	160188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_005363	CGA	2	6	163056	163061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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169	NC_005363	TAGA	2	8	171449	171456	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
170	NC_005363	AGC	2	6	173439	173444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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172	NC_005363	ATT	2	6	180490	180495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_005363	T	6	6	180511	180516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_005363	A	7	7	180544	180550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_005363	GAA	2	6	180556	180561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
176	NC_005363	TAAACT	2	12	182854	182865	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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178	NC_005363	A	7	7	182913	182919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_005363	AAC	2	6	182978	182983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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182	NC_005363	T	7	7	183214	183220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_005363	GTT	2	6	183237	183242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_005363	TGGGT	2	10	183325	183334	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
186	NC_005363	GT	3	6	183333	183338	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
187	NC_005363	T	6	6	183338	183343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_005363	CAA	2	6	190442	190447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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193	NC_005363	TGA	2	6	190613	190618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_005363	A	6	6	201025	201030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_005363	A	8	8	202710	202717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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246	NC_005363	CTT	2	6	251395	251400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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251	NC_005363	CCT	2	6	254895	254900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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262	NC_005363	ACT	2	6	270138	270143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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264	NC_005363	TCA	2	6	279801	279806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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268	NC_005363	A	6	6	293390	293395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_005363	TAA	2	6	293412	293417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_005363	GCA	2	6	293465	293470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_005363	CTG	2	6	293479	293484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_005363	T	6	6	293517	293522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_005363	AAAC	2	8	293542	293549	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
274	NC_005363	AGG	2	6	293564	293569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
275	NC_005363	GAC	2	6	294441	294446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_005363	ATT	2	6	294470	294475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_005363	TTC	2	6	297415	297420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_005363	A	7	7	297431	297437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_005363	G	7	7	297438	297444	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
281	NC_005363	TTG	2	6	299353	299358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_005363	TCG	2	6	301188	301193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_005363	T	6	6	301228	301233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_005363	GT	3	6	301252	301257	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
285	NC_005363	AAC	2	6	301323	301328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_005363	TCG	2	6	305494	305499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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288	NC_005363	TCA	2	6	305608	305613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_005363	TCT	2	6	305626	305631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_005363	AGG	2	6	305654	305659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
291	NC_005363	TAT	2	6	305980	305985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_005363	T	6	6	308316	308321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_005363	GGC	2	6	310601	310606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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297	NC_005363	CG	3	6	313572	313577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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322	NC_005363	TAT	2	6	322362	322367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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